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海南医科大学-小额采购公告(CB143862025000131)
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|地区:海南
|类型:采购公告
基本信息
信息类型:采购公告
区域:海南
源发布时间:2025-05-13
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基本信息:
采购单主题: 生物信息分析工作站(搭配流程)
采购单类型: 竞价类
设备类别: 其他信息化设备
使用币种: 人民币
小额采购开始时间: 2025-05-13 16:31
小额采购结束时间: 2025-05-20 17:31
备注: 采购要求:(一)参与本项目的供应商须保证供货的产品为完全符合采购方采购要求的正规渠道采购的全新原装正品,且提供免费质保三年;(二)如果供货产品在实际验收时不符合采购方的采购要求,则采购方不予验收、不予付款,一切责任由供应商承担。
 
采购详情:
具体项目需求文件或报价清单,请在供应商报价界面查阅。
设备名称 数量 单位 品牌 型号 是否标配 (免费送货上门安装及调试) 售后服务 技术要求 附件
生物信息分析工作站(搭配流程) 1 联想 联想工作站P620 按行业标准提供服务 一、硬件配置 1. 处理器(CPU):AMD Ryzen Threadripper PRO 3995WX,64核心128线程,基础频率2.7GHz,最高可加速至4.2GHz。 2. 内存(RAM):128GB DDR4 ECC REG内存 × 8条,总容量达1024GB(1TB) 3. 系统盘(SSD):1TB NVMe固态硬盘。 4. 数据存储盘(HDD):6块20TB企业级SATA硬盘,总容量120TB,搭载 专业级RAID独立阵列卡,支持RAID 0/1/5/6/10等模式。 5. 显卡(GPU):NVIDIA T400 4GB GDDR6专业显卡。 6. 电源与散热系统:1000W 80PLUS白金认证电源,采用工业级工作站机箱,配合高效风冷或液冷散热系统。 二、软件配置 安装Ubuntu 20.04.6 LTS操作系统。 1. 搭载宏基因组分析流程,具体如下: (1)原始数据质控与预处理:FastQC, Trimmomatic (2)基于reads的物种分类学分析:Kraken2, Bracken (3)序列拼接与基因预测:MEGAHIT, metaSPAdes, MetaGeneMark, Prokka (4)非冗余基因集构建与丰度计算:CD-HIT, Bowtie2, Salmon (5)功能注释:EggNOG, KEGG, COG, CAZy (6)抗生素抗性基因注释:CARD, ResFinder (7)碳、氮、硫、甲烷等代谢通路注释与功能解读 (8)多样本比较分析与可视化:Heatmap、Venn图、PCA、PCoA、NMDS、Hcluster等 (9)Binning分析与MAGs构建:MetaBAT2, MaxBin, CONCOCT (10)MAGs质量评估与物种注释:CheckM, GTDB-Tk (11) MAGs间冗余去除、基因注释、丰度分析 2. 搭载宏基因组分析流程,具体如下: (1)原始测序数据说明与质控,去除宿主污染:FastQC, Trimmomatic, Bowtie2 (2)序列拼接与病毒识别:MEGAHIT, VirSorter2, DeepVirFinder (3)病毒vOTUs生成与聚类:CD-HIT, vConTACT2 (4)vOTUs新颖性分析与完整度评估:CheckV (5)病毒物种注释与宿主预测:VirHostMatcher-Net, CRISPR spacer匹配 (6)病毒功能基因注释:DRAM-v, VOG, KEGG (7)病毒系统发育分析:IQ-TREE, FastTree (8)病毒丰度计算与多样本比较
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快照:2025-05-13
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